赛默飞离子色谱柱管内填有颗粒大小均匀的固定相，一般商品化离子色谱柱填料主要用5~15μm颗粒的高分子聚合物小球，特定场合下也采用无机氧化物（如硅胶）颗粒，目前离子色谱柱所用填料的颗粒主要为球形，而针对填料表面结构性质（孔隙的大小），填料可以分离微孔型、大孔型和超孔型，随着离子色谱应用于复杂样品越来越多，对离子色谱柱的交换容量要求也越来越高，超孔型填料也是离子色谱的一个发展趋势。 赛默飞离子色谱柱是离子色谱仪的核心部件之一，样品中各种离子的分离均在色谱柱中完成，并且一般比常规高效液相色谱柱价格要贵很多。因此，对赛默飞离子色谱柱的维护保养十分重要。
（1）接离子色谱柱前确保系统已清洗干净。色谱柱在任何情况下不能碰撞、弯曲或强烈震动；很多单位的离子色谱仪是阴、阳离子混用的，因此，接色谱柱前，一定要保证整个离子色谱仪上的所有阀件或管路已清洗干净，避免造成色谱柱堵塞。
（2）确保色谱柱不进入颗粒物。样品一定要经过预处理，去除颗粒物等会给泵和色谱柱带来负担的物质。
（3）确保离子色谱柱不干燥。每天分析工作结束后，要清洗进样阀中残留的样品，还要用适当的溶剂来清洗柱；若分析柱长期不使用，要参照色谱柱保存办法，在冲洗干净后，对阴离子柱要通入一定浓度的碱（对阳离子柱要通入一定浓度的酸），并将色谱柱取下两端密封保存。
（4）确保色谱柱在一定压力、流速条件下运行。仪器使用时一定要先检查整个流动管路中是否有气泡，如果有，需要先将气泡排除后再将色谱柱接上，防止将气泡带到色谱柱中。因为色谱柱中装填的树脂颗粒很小，气泡进入后将影响树脂和样品中离子的交换，同时气泡也将影响基线的稳定性。
