美国PE色谱柱的正确使用包含：加装保护柱，过滤流动相和样品，净化样品，避免过高的柱压等。
 

　　美国PE色谱柱加装保护柱的作用是过滤掉来自流动相和样品的化学“拉圾”同时也可以有效除去流动相和样品中的不溶物。尽管现在的色谱仪在流动相吸入口、进样阀后部以及在色谱柱的两端都装有不同孔径的滤器，但滤器只能除去不溶性颗粒而不能除去化学污然，因此，加装保护柱是必要的，特别是在分析中药、中成药等复杂混合物和生物样品时更是保护分析柱*的措施。保护柱填料应与分析柱一致，粒径可较分析柱大。保护柱属消耗品，经过一定次数的样品分析后，出现柱压显著升高或峰形变坏或基线漂移时，应考虑更换保护柱。
 

　　过滤流动相和样品：流动相通常由水或缓冲溶液与有机溶剂混合而成，原则上，所有经过色谱柱的流动相均应过滤，但在实际操作上应视具体情况而有所区别:当有机溶剂用色谱纯级，水用石英亚沸水或其它超纯水时，在能确保水和有机溶剂的质量且没有受到污染时，过滤并无更多实际意义。当流动相中含有缓冲盐时，则过滤是必要的，如前所述，当缓冲溶液放置一段时间后，在使用前还应重新过滤。装流动相的容器和色谱系统中的在线滤器要定期清洗和更换，以避免滤器因过载而起不到过滤作用。
 

　　净化样品：当样品中含有对色谱柱有损害的化学成分，如产生长久性吸附的蛋白质、糖等有机分子和强吸附性物质，以及可能对柱填料产生破坏作用的基团离子。在进样前应尽可能对样品进行分离提纯以除去多余杂质组分。
 

　　避免过高的柱压：虽然美国PE色谱柱能耐受的压力可达高，但过高及过大的压力变化均会缩短色谱柱的寿命，避免的方法是柱压过高时，尽可能采用较小的流速，以不超过柱最大允许压力的一半为宜。当流速较大时，应采取流速梯度的办法使流速分步到位。使用手动进样阀时，进样阀的切换要尽可能的快。否则超过20%的压力冲击会很快使柱报废。当使用多柱联用时，柱切换要避免在高压下进行。